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运用CRISPR基因编辑技术

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简介本文为深度编译,仅供交流学习,不代表智子说观点杜克大学的研究人员,运用CRISPR基因编辑技术,在人类基因组的“暗区”中,发现了一批此前未被识别的DNA片段。这些神秘的区域,负责调控细胞感知并响应其局 ...

本文为深度编译,暗区仅供交流学习 ,杜克大学不代表智子说观点

杜克大学的研究人员,运用CRISPR基因编辑技术 ,究绘在人类基因组的制基“暗区”中,发现了一批此前未被识别的因组[凡凡]科技辅助2.2暗区突围DNA片段。这些神秘的暗区区域 ,负责调控细胞感知并响应其局部环境物理特性的杜克大学机制 。

运用CRISPR基因编辑技术

理解这些DNA序列如何影响细胞的新研身份与功能 ,可能为那些涉及组织物理特性改变的究绘疾病(包括纤维化 、癌症、制基中风) ,因组以及神经退行性疾病 、暗区衰老等长期问题,杜克大学提供新的新研治疗靶点 。该研究已发表于《科学》(Science)期刊  。

细胞周围的局部环境,对其功能表现以及在不同组织中的发育特性,具有关键的Ray暗区2.4.7.apk作用 。我们已经知道,激素 、细胞因子等信号,乃至药物 ,都能塑造基因的表达。但组织的“硬度”或外部的物理作用力等机械结构  ,是如何影响细胞功能的,至今仍未被完全明晰。

“细胞微环境中的暗区公益直装无卡密机械刺激 ,是诸多基础细胞过程的强效调控因子 ,包括细胞的生长 、死亡 、分化和迁移” ,杜克大学生物医学工程系教授 、先进基因组技术中心(CAGT)主任查理·格斯巴赫指出 ,“我们知道这些物理刺激在组织发育 、再生 、衰老以及疾病(如纤维化和肿瘤形成)中起着关键作用,暗区公益直装但其具体的作用机制,一直难以被理解。”

“人类基因组中 ,仅有1%至2%的部分负责编码基因 。其余98%的基因组,显然在塑造细胞特性、本尊科技环境响应及疾病易感性方面发挥着重要作用 ,但直到最近,我们才拥有了能够探究这部分‘暗基因组’功能的goog暗区直装下载工具”,格斯巴赫的合作者克劳福德教授指出。

为理解细胞感知其机械环境的机制 ,他们的团队制备了能够模拟不同组织硬度的水凝胶 ,并在这些凝胶上培养细胞。研究人员随后运用测序工具,绘制出“开放染色质”(即可被访问的DNA)的区域图谱,从而确定了在每种硬度的凝胶上 ,细胞的基因表达与基因组结构所发生的变化。

“在不同的暗区突围改文件免费凝gel上培养仅20小时后 ,我们就观察到数千个基因的表达水平发生了变化 ,以及近五万个基因组区域的结构发生了改变” ,杜克大学生物医学工程副教授布伦特·霍夫曼表示 ,“这凸显了机械微环境对细胞生物学的深远影响。”

更具挑战性的,是确定“暗基因组”中的哪些变化,是通过增强特定基因的活性,来影响细胞功能的。为此,团队运用CRISPR技术,系统性地抑制了DNA各个区域的活性,并进而评估其对细胞生长和迁移的影响 。

那些因局部环境的物理特性而改变其结构 、影响了细胞的生长或迁移 、并调控了特定基因表达的区域,被研究团队命名为“机械增强子”(mechano-enhancers) ,以体现其调节细胞对环境响应的功能。

为了进一步解析“机械增强子”的功能及其在疾病中的作用,研究团队证实 ,在特发性肺纤维化(IPF)这种疾病中 ,这些“机械增强子”正在调控着与该疾病相关的基因活性。

“绘制这些‘机械增强子’的分布图,能深化我们对纤维化和癌症等、涉及组织力学特性改变的疾病机制的理解 ,并可能为开发新的药物靶点,或通过工程化手段来改变细胞感知病理性机械环境的方法,提供依据” ,该研究的博士后研究员布莱恩·科斯格罗夫表示。

作者信息

米凯拉·马丁内斯(My-kahla Martinez),杜克大学

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